陕西长青国家级自然保护区管理局是隶属陕西省林业厅全额拨款的正处级事业单位，人员编制167名。管理局机关下设保护管理科、信息和公众教育科、防火办（社区共管科）、项目与资金管理科、野外科研监测与合作交流中心等11个职能科室，基层单位有华阳中心保护站、茅坪中心保护站、洋县管理保障中心；中心保护站下辖杨家沟保护站、东坪保护站、杉树坪保护站。